DataDive: Research data
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- Research DataQuantifying the effect of molecular glues and interface residues on protein homodimer affinities by native mass spectrometry2025-12-19Biological processes rely on finely tuned homo- and heteromeric interactions between (biomacro)molecules. The strength of an interaction, typically given by the dissociation constant (KD), plays a crucial role in basic research and must be monitored throughout the development of drugs and agrochemicals. An ideal method for KD determination is applicable to various analytes with a large range of affinities, tolerates complex matrix compositions, does not require labeling, and simultaneously provides information on the structural integrity of the binding partners. Native mass spectrometry meets these criteria but typically struggles with homooligomeric complexes due to overlapping mass signals. To overcome this, we resolve monomer/dimer contributions to overlapping MS-peaks by separately analyzing the charge state distribution of each oligomeric species via sample dilution and covalent crosslinking. Following this approach, we show that quantitative Laser-Induced Liquid Bead Ion Desorption mass spectrometry (qLILBID-MS) accurately captures the affinities of Bovine Serum Albumin (BSA) and chemically induced dimers of Tryparedoxin (Tpx), an oxidoreductase from human pathogenic Trypanosoma brucei parasites, with various molecular glues and homodimer affinities. Conveniently, qLILBID-MS requires a fraction of sample used by other methods such as isothermal titration calorimetry (ITC) and yields previously inaccessible protein homodimer KDs in the high micromolar range, which allowed us to monitor the gradual decrease in homodimer affinity via mutation of crucial dimer interface contacts. Overall, qLILBID-MS is a sensitive, robust, fast, scalable, and cost-effective alternative to quantify protein/protein interactions, that can accelerate contemporary drug discovery workflows, e.g. the efficient screening for proximity inducing molecules like proteolysis targeting chimera (PROTACs) and molecular glues.
2 28 - Research DataDritte universitätsweite Studierendenbefragung 2022/23 der Goethe Universität Gesamtbericht2024-03-08Die dritte universitätsweite Studierendenbefragung der Goethe-Universität Frankfurt fand von Ende November 2022 bis Ende Januar 2023 statt und setzte den fünfjährigen Turnus nach 2012/13 und 2017/18 fort. Ziel der Befragung ist die datenbasierte Identifikation von Optimierungspotenzialen sowie zentralen Themen für die Weiterentwicklung von Studium und Lehre. Die Befragung stellt damit ein zentrales Instrument des Qualitätsmanagementsystems der Universität dar. Im vorliegenden Bericht werden die Ergebnisse des Basisbogens der Befragung 2023 dargestellt. Analysiert werden vornehmlich einzelne Fragestellungen deskriptiv; die Ergebnisse werden in Form von Tabellen und Grafiken aufbereitet. Erfasst wurden unter anderem die persönliche Lebenssituation, Bildungsverläufe, Einstellungen und Motivation, Studien- und Prüfungsbedingungen, Erfahrungen mit Diskriminierung und Barrierefreiheit, Unterstützungsangebote, Lehrverhalten sowie Lernverhalten und Lernergebnisse. Damit wird ein umfassender Einblick in die Situation und Perspektive der Studierenden ermöglicht. Die Ergebnisse können auf gesamtuniversitärer Ebene in hochschulstrategische Entscheidungen einfließen sowie auf Fachbereichs- und Studiengangebene die Weiterentwicklung und Reakkreditierung unterstützen. Der Bericht richtet sich an Entscheidungsträger*innen, zentrale Einrichtungen und die Hochschulöffentlichkeit und soll eine kompakte, datenbasierte Grundlage für Diskussionen und Entwicklungen im Bereich Studium und Lehre bieten.
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